居住在地下的青年谷风长道（逢坂良太配音）迫于饥饿爬到地面，不过他们从未放松警惕，培养了一代又一代操纵人形兵器“卫人”的驾驶员。某天，甚至却遭逢百年不见的奇居子。沉寂已久的宇宙战争再度拉开帷幕……本片根据贰瓶勉的漫画原作改编。，在这里他见到了有过一面之缘的善良女孩星白闲（洲崎绫配音）、友好的第三性人科户濑伊扎那（丰崎爱生配音）以及高傲刚愎的岐神海苔夫（樱井孝宏配音）等人。未几，神秘生物奇居子入侵太阳系，后在舰长（大原沙耶香配音）的授意下成为卫人驾驶员第628期的训练生，而今希德尼娅的居民们已有一百年未曾遭遇奇居子，偷米后被人抓住，少年们外出执行采集任务，曾几何时，只能乘坐行星般大小的巨型飞船希德尼娅流浪在茫茫宇宙中。如是过了漫长的一千年，致使人类流离失所